Fen Bilimleri Enstitüsü, 2002-2003 Eğitim-Öğretim yılında Lisansüstü eğitim-öğretimine başlamış olup Enstitüde halen 7 Anabilim Dalında 8 Yüksek Lisans programı açılmış bulunmaktadır.
Fen Bilimleri Enstitüsü, Üniversitemizin Mühendislik, Fen Edebiyat ve Mimarlık Fakültelerinin Bilgisayar Mühendisliği, Yönetim Bilişim Sistemleri, Endüstri Mühendisliği ve Elektrik-Elektronik Mühendisliği, Moleküler Biyoloji ve Genetik, Matematik, Mimarlık ve İçmimarlık alanlarında Tezli/Tezsiz Yüksek Lisans eğitim-öğretim programları yürütülmektedir.
Enstitünün Anabilim Dallarındaki programlar çerçevesinde yürütülen Yüksek Lisans çalışmalarında ülkemiz gelişimine ve teknolojik ilerlemesine katkısı olabilecek uzman kadroların yetişmesi amaçlanmaktadır.
